我國GMO管理體系說明
關於基因改造科技，世界各主要國家大多因應其國內政經社會環境與民意取向，而形成各該國家別具特色之基因改造科技管理政策，並衍生不同的發展模式與管理機制。
就我國而言，目前政府係透過既有法令體系進行分散式管理。而從基因改造科技發展之上中下游角度切入，各該管理階段之現況約略如下：
一、基礎研究
基礎研究階段目前係由國科會依據「基因重組實驗守則」進行管理。該守則係屬行政規則，旨在確保基因重組之實驗安全，惟其適用對象範圍尚稱有限，現階段僅限於接受國科會補助者，或接受其它政府機關委託或補助計畫而被間接要求者（目前僅部分計畫有此要求），應遵守國科會「基因重組實驗守則」外，其餘情形並無遵守之法律義務。
為解決適用對象有限及法位階問題，現階段國科會刻正研擬在「科學技術基本法」增定適合的法律授權依據，再據以訂定「基因改造科技研發管理辦法」（草案）。簡言之，國科會希望從源頭強化生物安全之管理，保障人員安全，並提高民眾對於此一科技之信心；至於細節性、技術性的基因改造科技相關操作規範，原則上將以「基因重組實驗守則」之規範內容為藍本，保留隨技術發展可適時調整規範內容之彈性。
二、田間試驗
我國並未針對田間試驗階段制定一般性管理規範，而係依據試驗標的﹙即基因改造生物﹚之屬性不同，分別訂定不同管理規範。
針對基因改造植物部分，係由農委會（農糧署）依據「植物品種及種苗法」及其相關子法（例如：「基因轉殖植物田間試驗管理辦法」、「基因轉殖植物之標示及包裝準則」、「基因轉殖植物遺傳特性調查及生物安全性評估原則」等），就基因改造植物進行田間試驗階段之相關管理機制，予以明確規範。
針對基因改造動物部分，係由農委會（畜牧處）依據「畜牧法」及其相關子法（例如：「基因轉殖種畜禽田間試驗及生物安全性評估管理辦法」）進行管理。
針對基因改造水產動植物部分，係由農委會（漁業署）依據「漁業法」及其相關子法（例如：「基因轉殖水產動植物田間試驗管理規則」）進行管理。
針對基因改造微生物部分，目前僅先針對環境用藥體系中之遺傳工程微生物製劑進行管理，此部分由環保署根據「環境用藥管理法」、「遺傳工程環境用藥微生物製劑開發試驗研究管理辦法」予以規範。而在另一方面，農委會亦刻正針對基因改造科技於農藥及動物用藥方面之運用，研議「農藥管理法」及「動物用藥管理法」之調整作業，以補強現行基因改造微生物管理機制之不足。
三、產品上市
基因改造科技之應用面向甚廣，其最終產品類型可能包括食品、飼料、觀賞用途產品、農藥、環境用藥及動物用藥等。針對基因改造產品之上市管理，我國並未制定一般性的專法，而係適用各該產品既有法令規定；而目前以基因改造食品與飼料之發展最為迅速普遍，其管理亦最受外界關注。
就基因改造食品而言，目前係由衛生署以「食品衛生管理法」及其相關子法、函令作為依據，進行管理。爰此，衛生署發布衛署食字第0900011745號函，將基因改造黃豆及玉米公告為指定食品，要求進行「食品衛生管理法」第14條之查驗登記，並訂定「基因改造食品安全性評估方法」作為審議標準；其次，衛生署依據「食品衛生管理法」第17條，發布衛署食字第0900011746號函，強制要求含基因改造黃豆或玉米之產品，應標示「基因改造」等字樣。除此以外，衛生署發行「基因改造食品安全性評估參考手冊」，同時陸續研議「基因改造微生物衍生食品安全性評估方法」（草案）、「基因改造動物衍生食品安全性評估方法」（草案），未來並將配合政策方向，循序擴大基因改造產品之管理品項範圍。
就基因改造飼料而言，為完善基因改造飼料之管理機制，農委會刻正進行「飼料管理法」之修正工作，據以作為管理基因改造飼料之法律依據；未來對於基因改造飼料的管理內容，原則上將比照基因改造食品，以確保食物鏈之安全性。
至於其他基因改造產品，由於目前我國基因改造科技的相關活動，絕大多數尚處於實驗研究階段，距離商業化利用之時間與可能性，均不易預期。因此在基因改造食品、基因改造飼料以外，現階段我國尚無考量其他基因改造產品之管理課題之需求。惟政府各部門仍將密切關注國內外基因改造科技發展情形，以適時評估其管理之必要性與急迫性。
四、輸出入
關於基因改造生物之輸出入活動，大略可分為二部分。其一，基因改造生物如係以環境釋放為輸出入目的者，農委會就特定類別基因改造生物的輸出入活動，另訂有其他管理規定，例如：針對基因改造植物，其在「植物品種及種苗法」之授權下，訂定「基因轉殖植物輸出入許可辦法」及「基因轉殖植物之標示及包裝準則」加以規範；針對基因改造動物，係依據「畜牧法」及「基因轉殖種畜禽及種源輸出入同意文件審核要點」加以管理；至於基因改造水產動植物、基因改造微生物，目前尚無針對輸出入活動的特別規定。
其次，倘若基因改造生物之輸出入，其主要目的並不在於環境釋放，比較不涉及生物安全的問題，而就此我國現行「食品衛生管理法」、「飼料管理法」等，設有一般性的規定，故基因改造產品即可援引適用，其相關管理措施與產品上市程序大致相當。現行實務上，衛生署即依據「食品衛生管理法」，以函釋公告指定將基因改造黃豆及玉米納入管理。
整體而言，針對基因改造生物之輸出入活動，現階段規範相當有限且尚待整合，未來各部會亦將視其管理之必要性與迫切性，就相關法制進行檢視，並配合調整。
五、其他：
除上述範圍之外，目前政府亦針對具有重大急迫性之項目，進行規範空白或灰色地帶進行釐清及補強。例如，針對商業種植之管理，我國迄今並無對應規範，惟基因改造科技跨部會工作小組成立後，業已凝聚「商業種植應嚴格管理」之多數意見趨向。為此，目前農委會將就基因改造植物之種植生產，研議適當之管理規範，以將基因改造植物之田間試驗、種植生產至上市前之管理納入規範。